贷款预存纠纷的处理可能受以下特殊情况影响，需您注意：
1. 合同中约定了仲裁条款：若贷款合同中明确约定因预存纠纷需提交仲裁机构解决，您将无法直接向法院起诉，需先通过仲裁程序维权。例如，合同中约定“因本合同产生的纠纷由XX仲裁委员会仲裁”，您起诉至法院时，法院会以存在仲裁条款为由驳回起诉。
2. 预存资金用于特定合法用途且双方自愿：若预存资金是用于抵扣贷款利息、保证金（合同明确约定返还条件）且您自愿同意，法院可能认定该预存行为合法，您的追回请求可能不被支持。例如，您与金融机构约定预存2万元作为贷款保证金，贷款结清后返还，您在贷款未结清时起诉要求返还，法院可能驳回您的请求。
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关于您咨询的“怎么办理贷款预存纠纷起诉追回损失”，首先需要明确起诉的核心是证明贷款预存行为违法或违约。以下为您分情况说明：
1. 若贷款预存是金融机构强制要求且未明确告知用途，您可起诉主张返还。
2. 若预存资金被金融机构变相转为利息或额外收费，您可起诉要求认定该条款无效并追回损失。
3. 若双方合同中明确约定预存资金用途且您自愿同意，但金融机构未按约定使用，您可起诉要求返还。
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在办理贷款预存纠纷起诉过程中，需避免以下常见错误操作：
1. 忽视诉讼时效：贷款预存纠纷的诉讼时效通常为3年，自您知道或应当知道权益受损之日起计算，超过时效起诉可能丧失胜诉权。
2. 证据保存不当：未妥善保存贷款合同、转账凭证等关键证据，或证据存在涂改、缺失等情况，导致无法证明预存行为及损失。
3. 盲目协商：与金融机构协商时未明确自身诉求，或在协商过程中承认自身存在过错，反而不利于后续起诉。
若您对诉讼流程或证据收集有疑问，建议进一步向律师咨询，避免因错误操作影响维权结果。
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针对贷款预存纠纷起诉的法律依据，主要涉及《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定。
根据《民法典》第496条，格式条款提供者应采取合理方式提示对方注意免除或减轻其责任等与对方有重大利害关系的条款，未履行提示或说明义务的，对方可主张该条款不成为合同内容。若金融机构未明确告知贷款预存的条件、用途及后果，您可依据此条主张预存条款无效。《消费者权益保护法》第8条规定消费者享有知悉其购买、使用的商品或接受的服务真实情况的权利，金融机构隐瞒预存资金真实用途构成侵犯知情权，您可据此起诉要求返还预存资金。综上，若金融机构存在未履行提示义务或隐瞒真实情况的行为，您的起诉主张具有法律依据。

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